MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002679	TGGA	2	8	332259	332266	25 %	25 %	50 %	0 %	13488310
5502	NC_002679	CAGC	2	8	332270	332277	25 %	0 %	25 %	50 %	13488310
5503	NC_002679	A	6	6	332294	332299	100 %	0 %	0 %	0 %	13488310
5504	NC_002679	GAG	2	6	332329	332334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488310
5505	NC_002679	TGC	2	6	332343	332348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488310
5506	NC_002679	AGT	2	6	332361	332366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488310
5507	NC_002679	TCG	2	6	332381	332386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488310
5508	NC_002679	TCA	2	6	332399	332404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488310
5509	NC_002679	TCG	2	6	332407	332412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488310
5510	NC_002679	AGA	2	6	332496	332501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488310
5511	NC_002679	GCG	2	6	332515	332520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488310
5512	NC_002679	AAC	2	6	332528	332533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488310
5513	NC_002679	CCGA	2	8	332614	332621	25 %	0 %	25 %	50 %	13488310
5514	NC_002679	CCT	2	6	332643	332648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488310
5515	NC_002679	CAGCG	2	10	332682	332691	20 %	0 %	40 %	40 %	13488310
5516	NC_002679	ATG	2	6	332692	332697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488310
5517	NC_002679	GC	3	6	332714	332719	0 %	0 %	50 %	50 %	13488310
5518	NC_002679	CTG	2	6	332749	332754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488310
5519	NC_002679	CAT	2	6	332781	332786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488310
5520	NC_002679	TAT	2	6	332863	332868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488310
5521	NC_002679	C	7	7	332901	332907	0 %	0 %	0 %	100 %	13488310
5522	NC_002679	GCT	2	6	332955	332960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488310
5523	NC_002679	GAT	2	6	332970	332975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488310
5524	NC_002679	CAC	2	6	333094	333099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488311
5525	NC_002679	GCT	2	6	333157	333162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488311
5526	NC_002679	AG	3	6	333216	333221	50 %	0 %	50 %	0 %	13488311
5527	NC_002679	GACG	2	8	333272	333279	25 %	0 %	50 %	25 %	13488311
5528	NC_002679	GGT	2	6	333367	333372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488311
5529	NC_002679	TCG	2	6	333381	333386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488311
5530	NC_002679	CGA	2	6	333424	333429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488311
5531	NC_002679	GCG	3	9	333480	333488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488311
5532	NC_002679	GGCGC	2	10	333632	333641	0 %	0 %	60 %	40 %	13488311
5533	NC_002679	ATC	2	6	333647	333652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488311
5534	NC_002679	TGG	2	6	333727	333732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488311
5535	NC_002679	CCGT	2	8	333773	333780	0 %	25 %	25 %	50 %	13488311
5536	NC_002679	CGT	2	6	333805	333810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488311
5537	NC_002679	CCG	3	9	333909	333917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488311
5538	NC_002679	TGCT	2	8	334050	334057	0 %	50 %	25 %	25 %	13488311
5539	NC_002679	CGCC	2	8	334072	334079	0 %	0 %	25 %	75 %	13488311
5540	NC_002679	CGG	2	6	334090	334095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488311
5541	NC_002679	CGC	2	6	334225	334230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488311
5542	NC_002679	GCC	2	6	334244	334249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488311
5543	NC_002679	TGG	2	6	334290	334295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488311
5544	NC_002679	AAC	2	6	334398	334403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488311
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5547	NC_002679	G	7	7	334817	334823	0 %	0 %	100 %	0 %	13488312
5548	NC_002679	ACG	2	6	334828	334833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488312
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5551	NC_002679	TAA	2	6	335039	335044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488312
5552	NC_002679	TCG	2	6	335056	335061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488312
5553	NC_002679	GTC	2	6	335130	335135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488312
5554	NC_002679	GTTT	2	8	335218	335225	0 %	75 %	25 %	0 %	13488312
5555	NC_002679	GAA	2	6	335324	335329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488312
5556	NC_002679	CAA	2	6	335394	335399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488312
5557	NC_002679	CGG	2	6	335456	335461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488312
5558	NC_002679	G	6	6	335522	335527	0 %	0 %	100 %	0 %	13488312
5559	NC_002679	CTG	2	6	335637	335642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488312
5560	NC_002679	AAT	2	6	335673	335678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488312
5561	NC_002679	CGT	3	9	335687	335695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488312
5562	NC_002679	ACG	2	6	335701	335706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488312
5563	NC_002679	A	6	6	335717	335722	100 %	0 %	0 %	0 %	13488312
5564	NC_002679	CG	3	6	335738	335743	0 %	0 %	50 %	50 %	13488312
5565	NC_002679	AATG	2	8	335748	335755	50 %	25 %	25 %	0 %	13488312
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5569	NC_002679	CG	3	6	336162	336167	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
5570	NC_002679	CG	3	6	336237	336242	0 %	0 %	50 %	50 %	13488313
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5573	NC_002679	TGG	2	6	336453	336458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488313
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5575	NC_002679	GCAACA	2	12	336549	336560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	13488313
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5581	NC_002679	AAC	2	6	336839	336844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488313
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5583	NC_002679	TGCCA	2	10	336918	336927	20 %	20 %	20 %	40 %	13488314
5584	NC_002679	AATC	2	8	336942	336949	50 %	25 %	0 %	25 %	13488314
5585	NC_002679	CGC	2	6	336960	336965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488314
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5589	NC_002679	GTC	2	6	337204	337209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488314
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5591	NC_002679	GAT	2	6	337272	337277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488314
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5593	NC_002679	TGG	2	6	337445	337450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488314
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5595	NC_002679	CAT	2	6	337524	337529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488314
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5597	NC_002679	ATG	2	6	337606	337611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488314
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5599	NC_002679	CTG	2	6	337681	337686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488314
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5603	NC_002679	TCG	2	6	337846	337851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488315
5604	NC_002679	CGG	2	6	337943	337948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
5605	NC_002679	GCG	2	6	338004	338009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488315
5606	NC_002679	G	6	6	338017	338022	0 %	0 %	100 %	0 %	13488315
5607	NC_002679	GC	3	6	338049	338054	0 %	0 %	50 %	50 %	13488315
5608	NC_002679	CAGCC	2	10	338135	338144	20 %	0 %	20 %	60 %	13488315
5609	NC_002679	GCT	2	6	338162	338167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488315
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5611	NC_002679	TTC	2	6	338226	338231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488315
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5613	NC_002679	CTCG	2	8	338319	338326	0 %	25 %	25 %	50 %	13488315
5614	NC_002679	GCAC	2	8	338364	338371	25 %	0 %	25 %	50 %	13488315
5615	NC_002679	GA	3	6	338608	338613	50 %	0 %	50 %	0 %	13488315
5616	NC_002679	GATCGA	2	12	338621	338632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13488315
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5618	NC_002679	TGCT	2	8	338675	338682	0 %	50 %	25 %	25 %	13488315
5619	NC_002679	CCG	2	6	338710	338715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488315
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5622	NC_002679	TCGC	2	8	338796	338803	0 %	25 %	25 %	50 %	13488315
5623	NC_002679	GGTG	2	8	338812	338819	0 %	25 %	75 %	0 %	13488315
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